Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAF1Q13077 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF1Q13077 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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