Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPN11Q06124 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPN11Q06124 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms