Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELAQ04206 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELAQ04206 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELAQ04206 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELAQ04206 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELAQ04206 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELAQ04206 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELAQ04206 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELAQ04206 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELAQ04206 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELAQ04206 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELAQ04206 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELAQ04206 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELAQ04206 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELAQ04206 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELAQ04206 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELAQ04206 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELAQ04206 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELAQ04206 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RELAQ04206 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELAQ04206 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELAQ04206 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELAQ04206 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELAQ04206 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELAQ04206 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELAQ04206 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELAQ04206 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELAQ04206 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELAQ04206 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELAQ04206 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELAQ04206 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELAQ04206 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELAQ04206 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELAQ04206 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELAQ04206 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELAQ04206 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELAQ04206 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELAQ04206 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELAQ04206 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELAQ04206 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELAQ04206 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELAQ04206 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RELAQ04206 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RELAQ04206 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RELAQ04206 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELAQ04206 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELAQ04206 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELAQ04206 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RELAQ04206 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELAQ04206 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELAQ04206 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELAQ04206 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELAQ04206 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELAQ04206 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELAQ04206 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELAQ04206 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELAQ04206 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELAQ04206 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RELAQ04206 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELAQ04206 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELAQ04206 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELAQ04206 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELAQ04206 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELAQ04206 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELAQ04206 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELAQ04206 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELAQ04206 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELAQ04206 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELAQ04206 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELAQ04206 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RELAQ04206 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms