Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC25A11Q02978 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC25A11Q02978 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms