Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPCQ01831 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPCQ01831 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPCQ01831 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPCQ01831 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPCQ01831 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPCQ01831 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPCQ01831 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPCQ01831 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPCQ01831 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPCQ01831 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPCQ01831 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
XPCQ01831 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPCQ01831 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPCQ01831 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
XPCQ01831 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPCQ01831 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPCQ01831 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPCQ01831 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPCQ01831 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPCQ01831 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPCQ01831 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPCQ01831 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPCQ01831 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XPCQ01831 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XPCQ01831 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XPCQ01831 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XPCQ01831 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XPCQ01831 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
XPCQ01831 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XPCQ01831 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XPCQ01831 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
XPCQ01831 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
XPCQ01831 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XPCQ01831 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
XPCQ01831 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XPCQ01831 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPCQ01831 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPCQ01831 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPCQ01831 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPCQ01831 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPCQ01831 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPCQ01831 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPCQ01831 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPCQ01831 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPCQ01831 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPCQ01831 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
XPCQ01831 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPCQ01831 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPCQ01831 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPCQ01831 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPCQ01831 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPCQ01831 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
XPCQ01831 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPCQ01831 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPCQ01831 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XPCQ01831 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
XPCQ01831 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
XPCQ01831 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
XPCQ01831 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
XPCQ01831 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
XPCQ01831 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
XPCQ01831 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
XPCQ01831 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
XPCQ01831 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
XPCQ01831 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
XPCQ01831 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
XPCQ01831 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
XPCQ01831 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
XPCQ01831 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
XPCQ01831 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
XPCQ01831 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
XPCQ01831 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XPCQ01831 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XPCQ01831 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XPCQ01831 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XPCQ01831 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
XPCQ01831 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
XPCQ01831 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
XPCQ01831 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
XPCQ01831 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XPCQ01831 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
XPCQ01831 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XPCQ01831 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XPCQ01831 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XPCQ01831 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
XPCQ01831 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XPCQ01831 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XPCQ01831 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XPCQ01831 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XPCQ01831 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XPCQ01831 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XPCQ01831 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
XPCQ01831 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XPCQ01831 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
XPCQ01831 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
XPCQ01831 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XPCQ01831 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XPCQ01831 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
XPCQ01831 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms