Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CLTCQ00610 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms