Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RIPPLY3P57055 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIPPLY3P57055 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms