Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLTPP55058 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PLTPP55058 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PLTPP55058 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PLTPP55058 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PLTPP55058 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLTPP55058 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PLTPP55058 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLTPP55058 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLTPP55058 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PLTPP55058 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLTPP55058 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLTPP55058 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLTPP55058 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLTPP55058 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLTPP55058 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLTPP55058 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLTPP55058 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLTPP55058 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLTPP55058 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLTPP55058 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLTPP55058 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLTPP55058 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLTPP55058 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLTPP55058 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLTPP55058 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLTPP55058 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLTPP55058 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLTPP55058 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLTPP55058 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLTPP55058 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLTPP55058 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLTPP55058 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLTPP55058 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLTPP55058 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLTPP55058 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLTPP55058 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLTPP55058 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLTPP55058 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLTPP55058 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLTPP55058 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLTPP55058 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLTPP55058 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLTPP55058 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLTPP55058 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms