Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC34P49427 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC34P49427 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC34P49427 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC34P49427 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC34P49427 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC34P49427 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC34P49427 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC34P49427 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC34P49427 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC34P49427 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC34P49427 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC34P49427 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC34P49427 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC34P49427 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC34P49427 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC34P49427 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC34P49427 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC34P49427 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC34P49427 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC34P49427 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC34P49427 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC34P49427 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms