Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNNI2P48788 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNNI2P48788 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms