Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NESP48681 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NESP48681 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NESP48681 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NESP48681 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NESP48681 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NESP48681 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NESP48681 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NESP48681 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NESP48681 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NESP48681 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NESP48681 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NESP48681 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NESP48681 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NESP48681 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NESP48681 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NESP48681 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NESP48681 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NESP48681 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NESP48681 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NESP48681 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NESP48681 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NESP48681 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NESP48681 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
NESP48681 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
NESP48681 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NESP48681 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NESP48681 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NESP48681 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
NESP48681 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NESP48681 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NESP48681 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NESP48681 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
NESP48681 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NESP48681 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
NESP48681 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NESP48681 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NESP48681 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NESP48681 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NESP48681 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NESP48681 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NESP48681 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
NESP48681 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NESP48681 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NESP48681 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NESP48681 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NESP48681 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NESP48681 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NESP48681 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NESP48681 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NESP48681 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NESP48681 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NESP48681 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NESP48681 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NESP48681 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NESP48681 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NESP48681 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NESP48681 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
NESP48681 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NESP48681 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NESP48681 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NESP48681 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NESP48681 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NESP48681 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NESP48681 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NESP48681 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NESP48681 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NESP48681 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NESP48681 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NESP48681 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NESP48681 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NESP48681 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NESP48681 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NESP48681 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NESP48681 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
NESP48681 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
NESP48681 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
NESP48681 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3.01
NESP48681 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3.01
NESP48681 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
NESP48681 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NESP48681 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NESP48681 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NESP48681 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
NESP48681 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
NESP48681 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NESP48681 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
NESP48681 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC33.82■■■■□ 3
NESP48681 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NESP48681 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
NESP48681 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NESP48681 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NESP48681 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
NESP48681 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC33.81■■■■□ 3
NESP48681 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
NESP48681 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NESP48681 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC33.81■■■■□ 3
NESP48681 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
NESP48681 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NESP48681 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms