Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCAMP43121 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCAMP43121 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCAMP43121 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCAMP43121 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCAMP43121 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCAMP43121 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MCAMP43121 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCAMP43121 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCAMP43121 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCAMP43121 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCAMP43121 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCAMP43121 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCAMP43121 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCAMP43121 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCAMP43121 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCAMP43121 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCAMP43121 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCAMP43121 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCAMP43121 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCAMP43121 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCAMP43121 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCAMP43121 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCAMP43121 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCAMP43121 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCAMP43121 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCAMP43121 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCAMP43121 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCAMP43121 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCAMP43121 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCAMP43121 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCAMP43121 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCAMP43121 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCAMP43121 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCAMP43121 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCAMP43121 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MCAMP43121 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCAMP43121 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MCAMP43121 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCAMP43121 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCAMP43121 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCAMP43121 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCAMP43121 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MCAMP43121 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCAMP43121 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MCAMP43121 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCAMP43121 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCAMP43121 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCAMP43121 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MCAMP43121 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCAMP43121 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCAMP43121 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCAMP43121 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCAMP43121 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCAMP43121 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCAMP43121 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCAMP43121 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCAMP43121 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCAMP43121 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCAMP43121 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCAMP43121 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCAMP43121 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCAMP43121 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MCAMP43121 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MCAMP43121 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCAMP43121 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MCAMP43121 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCAMP43121 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCAMP43121 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCAMP43121 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCAMP43121 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCAMP43121 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCAMP43121 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCAMP43121 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCAMP43121 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCAMP43121 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCAMP43121 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCAMP43121 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MCAMP43121 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCAMP43121 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCAMP43121 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCAMP43121 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCAMP43121 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCAMP43121 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCAMP43121 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCAMP43121 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCAMP43121 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCAMP43121 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCAMP43121 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCAMP43121 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCAMP43121 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCAMP43121 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCAMP43121 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCAMP43121 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCAMP43121 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCAMP43121 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCAMP43121 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCAMP43121 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MCAMP43121 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCAMP43121 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms