Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXD12P35452 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms