Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM4SF1P30408 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms