Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTGFP29279 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTGFP29279 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTGFP29279 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTGFP29279 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTGFP29279 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTGFP29279 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTGFP29279 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTGFP29279 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTGFP29279 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTGFP29279 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTGFP29279 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTGFP29279 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTGFP29279 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTGFP29279 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTGFP29279 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTGFP29279 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTGFP29279 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTGFP29279 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTGFP29279 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTGFP29279 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTGFP29279 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTGFP29279 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTGFP29279 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTGFP29279 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTGFP29279 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTGFP29279 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTGFP29279 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTGFP29279 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTGFP29279 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTGFP29279 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTGFP29279 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTGFP29279 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTGFP29279 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTGFP29279 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTGFP29279 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTGFP29279 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTGFP29279 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTGFP29279 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTGFP29279 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTGFP29279 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTGFP29279 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTGFP29279 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTGFP29279 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTGFP29279 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTGFP29279 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTGFP29279 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTGFP29279 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTGFP29279 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTGFP29279 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTGFP29279 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTGFP29279 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTGFP29279 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTGFP29279 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTGFP29279 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTGFP29279 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTGFP29279 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTGFP29279 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTGFP29279 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTGFP29279 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTGFP29279 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTGFP29279 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTGFP29279 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTGFP29279 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTGFP29279 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTGFP29279 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTGFP29279 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTGFP29279 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTGFP29279 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTGFP29279 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTGFP29279 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTGFP29279 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTGFP29279 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTGFP29279 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTGFP29279 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTGFP29279 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTGFP29279 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTGFP29279 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTGFP29279 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTGFP29279 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTGFP29279 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTGFP29279 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTGFP29279 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTGFP29279 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTGFP29279 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTGFP29279 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTGFP29279 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTGFP29279 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTGFP29279 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTGFP29279 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTGFP29279 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTGFP29279 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTGFP29279 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTGFP29279 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTGFP29279 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTGFP29279 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTGFP29279 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTGFP29279 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTGFP29279 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTGFP29279 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms