Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD34P28906 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD34P28906 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD34P28906 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD34P28906 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD34P28906 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD34P28906 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD34P28906 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD34P28906 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD34P28906 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD34P28906 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD34P28906 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD34P28906 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD34P28906 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CD34P28906 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD34P28906 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD34P28906 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD34P28906 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD34P28906 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD34P28906 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD34P28906 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD34P28906 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD34P28906 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD34P28906 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD34P28906 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD34P28906 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD34P28906 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD34P28906 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD34P28906 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD34P28906 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD34P28906 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CD34P28906 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD34P28906 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD34P28906 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD34P28906 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD34P28906 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD34P28906 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD34P28906 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD34P28906 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD34P28906 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD34P28906 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD34P28906 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD34P28906 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD34P28906 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD34P28906 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD34P28906 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD34P28906 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD34P28906 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD34P28906 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD34P28906 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD34P28906 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD34P28906 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD34P28906 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD34P28906 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD34P28906 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD34P28906 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD34P28906 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD34P28906 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD34P28906 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD34P28906 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD34P28906 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD34P28906 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD34P28906 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD34P28906 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD34P28906 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD34P28906 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD34P28906 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD34P28906 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD34P28906 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD34P28906 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD34P28906 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD34P28906 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD34P28906 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD34P28906 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms