Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLD1P28340 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POLD1P28340 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLD1P28340 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLD1P28340 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLD1P28340 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLD1P28340 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLD1P28340 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POLD1P28340 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLD1P28340 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLD1P28340 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLD1P28340 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLD1P28340 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLD1P28340 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLD1P28340 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLD1P28340 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLD1P28340 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLD1P28340 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLD1P28340 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLD1P28340 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLD1P28340 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLD1P28340 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLD1P28340 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLD1P28340 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLD1P28340 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLD1P28340 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLD1P28340 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLD1P28340 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLD1P28340 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLD1P28340 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLD1P28340 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLD1P28340 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLD1P28340 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLD1P28340 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLD1P28340 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POLD1P28340 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLD1P28340 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLD1P28340 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POLD1P28340 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLD1P28340 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POLD1P28340 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLD1P28340 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLD1P28340 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLD1P28340 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLD1P28340 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLD1P28340 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLD1P28340 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POLD1P28340 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POLD1P28340 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLD1P28340 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLD1P28340 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLD1P28340 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLD1P28340 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLD1P28340 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLD1P28340 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLD1P28340 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLD1P28340 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLD1P28340 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLD1P28340 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLD1P28340 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLD1P28340 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLD1P28340 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLD1P28340 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLD1P28340 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLD1P28340 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLD1P28340 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLD1P28340 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLD1P28340 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLD1P28340 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLD1P28340 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLD1P28340 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLD1P28340 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLD1P28340 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLD1P28340 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POLD1P28340 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLD1P28340 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLD1P28340 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLD1P28340 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLD1P28340 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLD1P28340 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POLD1P28340 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLD1P28340 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLD1P28340 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLD1P28340 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLD1P28340 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLD1P28340 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLD1P28340 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLD1P28340 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLD1P28340 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLD1P28340 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLD1P28340 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLD1P28340 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLD1P28340 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLD1P28340 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLD1P28340 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLD1P28340 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLD1P28340 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLD1P28340 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLD1P28340 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLD1P28340 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms