Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXB3P14651 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB3P14651 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms