Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1P11387 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1P11387 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1P11387 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1P11387 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1P11387 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1P11387 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1P11387 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1P11387 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1P11387 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1P11387 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1P11387 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1P11387 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1P11387 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TOP1P11387 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1P11387 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1P11387 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1P11387 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1P11387 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1P11387 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1P11387 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1P11387 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1P11387 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1P11387 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1P11387 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1P11387 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1P11387 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1P11387 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1P11387 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1P11387 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1P11387 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1P11387 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1P11387 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1P11387 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1P11387 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1P11387 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TOP1P11387 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1P11387 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1P11387 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1P11387 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1P11387 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1P11387 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1P11387 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1P11387 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1P11387 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1P11387 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1P11387 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1P11387 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1P11387 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1P11387 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1P11387 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1P11387 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1P11387 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TOP1P11387 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1P11387 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1P11387 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1P11387 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1P11387 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1P11387 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1P11387 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1P11387 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1P11387 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1P11387 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1P11387 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1P11387 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1P11387 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1P11387 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1P11387 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1P11387 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1P11387 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1P11387 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1P11387 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TOP1P11387 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1P11387 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1P11387 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1P11387 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1P11387 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1P11387 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1P11387 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1P11387 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1P11387 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1P11387 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1P11387 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1P11387 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1P11387 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1P11387 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1P11387 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1P11387 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1P11387 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TOP1P11387 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP1P11387 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP1P11387 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP1P11387 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP1P11387 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP1P11387 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP1P11387 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP1P11387 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP1P11387 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP1P11387 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TOP1P11387 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms