Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTMAP06454 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTMAP06454 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTMAP06454 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTMAP06454 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTMAP06454 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTMAP06454 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTMAP06454 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTMAP06454 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTMAP06454 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTMAP06454 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTMAP06454 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTMAP06454 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTMAP06454 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTMAP06454 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTMAP06454 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTMAP06454 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTMAP06454 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTMAP06454 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTMAP06454 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTMAP06454 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTMAP06454 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTMAP06454 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTMAP06454 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTMAP06454 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTMAP06454 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTMAP06454 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTMAP06454 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTMAP06454 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTMAP06454 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTMAP06454 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTMAP06454 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTMAP06454 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTMAP06454 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTMAP06454 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTMAP06454 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTMAP06454 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTMAP06454 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTMAP06454 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTMAP06454 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTMAP06454 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTMAP06454 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTMAP06454 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTMAP06454 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTMAP06454 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTMAP06454 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTMAP06454 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTMAP06454 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTMAP06454 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTMAP06454 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTMAP06454 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTMAP06454 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTMAP06454 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTMAP06454 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTMAP06454 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTMAP06454 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTMAP06454 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTMAP06454 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTMAP06454 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTMAP06454 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTMAP06454 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTMAP06454 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTMAP06454 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTMAP06454 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTMAP06454 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTMAP06454 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTMAP06454 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTMAP06454 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTMAP06454 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTMAP06454 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTMAP06454 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTMAP06454 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTMAP06454 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTMAP06454 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTMAP06454 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTMAP06454 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTMAP06454 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTMAP06454 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTMAP06454 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTMAP06454 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTMAP06454 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTMAP06454 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTMAP06454 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTMAP06454 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTMAP06454 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTMAP06454 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTMAP06454 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTMAP06454 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTMAP06454 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTMAP06454 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTMAP06454 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTMAP06454 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTMAP06454 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTMAP06454 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTMAP06454 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTMAP06454 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTMAP06454 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTMAP06454 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTMAP06454 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTMAP06454 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms