Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA21P01568 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms