Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRRM5B3KS81 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms