Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VWA3AA6NCI4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms