Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms