Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms