Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
DUSP9Q99956 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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