Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTF1AQ7RTS3 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTF1AQ7RTS3 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PTF1AQ7RTS3 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PTF1AQ7RTS3 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms