Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FSCN1Q16658 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms