Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL355483.3-201ENST00000446686 752 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms