Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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SYCP1Q15431 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SYCP1Q15431 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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