Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL4A6Q14031 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms