Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RN7SL259P-201ENST00000478499 253 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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