Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGB3BPQ13352 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms