Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.5 ms