Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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