Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXD4Q12950 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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