Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRMP28827 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 AC097478.1-206ENST00000513572 2010 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRMP28827 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms