Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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ZBED1O96006 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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ZBED1O96006 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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ZBED1O96006 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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ZBED1O96006 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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ZBED1O96006 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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ZBED1O96006 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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ZBED1O96006 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
ZBED1O96006 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ZBED1O96006 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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