Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
RFXAPO00287 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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