Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 ZNF23-204ENST00000428724 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC112719.2-201ENST00000501239 1685 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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FOXQ1Q9C009 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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FOXQ1Q9C009 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 SLC13A1-204ENST00000539873 2222 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
FOXQ1Q9C009 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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