Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 HMCN2-206ENST00000624552 15610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LRRIQ1Q96JM4 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms