Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 NCKAP5-201ENST00000317721 7593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 NCKAP5-205ENST00000409261 7594 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 SCAF11-205ENST00000465950 5296 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LAMA3Q16787 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 DPY19L3-205ENST00000586987 5925 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 TNFRSF9-204ENST00000615230 5970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC245060.6-201ENST00000624350 8420 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 DNAH9-201ENST00000262442 13750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 SZT2-209ENST00000562955 13968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 DST-207ENST00000421834 18030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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LAMA3Q16787 BMPR1A-201ENST00000372037 11255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 WDR7-213ENST00000615645 5257 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 CAND1-208ENST00000545606 11251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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