Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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