Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
CBFBQ13951 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms