Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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