Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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ITGA7Q13683 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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ITGA7Q13683 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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ITGA7Q13683 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGA7Q13683 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ITGA7Q13683 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
ITGA7Q13683 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
ITGA7Q13683 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ITGA7Q13683 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
ITGA7Q13683 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ITGA7Q13683 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ITGA7Q13683 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ITGA7Q13683 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ITGA7Q13683 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ITGA7Q13683 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ITGA7Q13683 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ITGA7Q13683 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ITGA7Q13683 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ITGA7Q13683 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ITGA7Q13683 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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