Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL1Q13616 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms