Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 AC122688.4-201ENST00000623279 4394 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 TNR-202ENST00000367674 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 LINC01829-202ENST00000433133 2100 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 OTOA-204ENST00000388958 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 CTNNA2-209ENST00000466387 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 TSPAN31-206ENST00000547992 3434 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 HRH4-201ENST00000256906 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 CCDC62-203ENST00000392440 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 RBM7-204ENST00000541475 6725 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 ATP1A4-201ENST00000368081 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 C8orf44-201ENST00000390159 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 AC068512.1-201ENST00000584542 1811 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 LIG4-202ENST00000405925 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 LINC02102-201ENST00000503989 3364 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 URB1-201ENST00000382751 10832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 BCLAF3-203ENST00000379687 6528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 AL008638.6-201ENST00000623947 4254 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 AC016027.2-201ENST00000441167 2493 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 PCBP1-AS1-243ENST00000458698 1893 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 S100A5-202ENST00000368718 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 STAMBP-203ENST00000394073 6386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 AL603650.1-201ENST00000412680 240 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 AL050320.1-201ENST00000420044 446 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 GGT3P-203ENST00000445651 368 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 RPL7P17-201ENST00000470927 724 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 AC026700.1-201ENST00000512074 544 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 AL591767.2-201ENST00000554984 173 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 AC114546.2-201ENST00000560683 477 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 BNIP3P15-201ENST00000604600 301 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 WDR87-201ENST00000303868 8847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 TFDP2-212ENST00000486111 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 CEACAMP3-201ENST00000473762 1548 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 ATP5A1P3-201ENST00000573189 1507 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 ZNF43-201ENST00000354959 2881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 GTF2IP1-202ENST00000614592 2047 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 MAPT-AS1-204ENST00000634876 3602 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 ZNF396-201ENST00000306346 2788 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 ARMC3-204ENST00000409983 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 DNAJC18-201ENST00000302060 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 ATP6V0D2-201ENST00000285393 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 DHFR2-201ENST00000314636 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 RRP8-201ENST00000254605 6560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 ATF7IP-221ENST00000543189 4887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 GRIK1-202ENST00000389124 2712 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 ABCB1-211ENST00000622132 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 FBXO11-202ENST00000403359 4055 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 NF1P2-201ENST00000556855 2505 ntBASIC8□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 FAM186A-204ENST00000543111 8200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
CAMK2BQ13554 THBS3-210ENST00000541576 3200 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms