Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CCDC30-202ENST00000342022 3098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 TCF7L2-209ENST00000369395 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 PBLD-202ENST00000309049 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 FAM13C-216ENST00000618427 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 CTNND1-202ENST00000361332 6295 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AP001528.3-201ENST00000624364 3249 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 LRRC8B-203ENST00000439853 7474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 MAP4-209ENST00000434267 2772 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RBM46-202ENST00000510397 3626 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RN7SKP63-201ENST00000363187 301 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 SLC2A11-205ENST00000403208 564 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RN7SKP131-201ENST00000410698 301 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC064875.1-203ENST00000422996 582 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC104009.1-201ENST00000528009 635 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 TIMM9-205ENST00000555404 430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC026464.1-202ENST00000564737 722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC005262.1-201ENST00000588562 362 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC005884.2-201ENST00000593107 247 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 LAMB4-202ENST00000388781 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 GDNF-AS1-203ENST00000514532 2913 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 TTC26-202ENST00000430935 4198 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 TMEM169-201ENST00000295658 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ZNF343-208ENST00000617391 3300 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 CU633906.2-201ENST00000624576 2257 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC131392.2-201ENST00000505635 4332 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 GOLGA8B-202ENST00000438958 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 LINC01695-203ENST00000453420 4486 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 GTF2IP12-202ENST00000634317 5052 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 LPAR6-202ENST00000378434 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 NUDT4-206ENST00000549992 3607 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 USP6-201ENST00000250066 7976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 HINFP-201ENST00000350777 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 UBE2V1-202ENST00000371657 1973 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 DNAH10-201ENST00000409039 14473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 CTNND1-221ENST00000529873 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 CTNND1-227ENST00000530748 5925 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 CCL28-201ENST00000361115 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 HNRNPA2B1-201ENST00000354667 3664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 OR1G1-201ENST00000328890 998 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 IGLJ2-201ENST00000390322 175 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC083864.2-201ENST00000446024 482 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN3Q13064 CSF2RA-217ENST00000494969 489 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
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