Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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FOXO1Q12778 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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FOXO1Q12778 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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FOXO1Q12778 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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FOXO1Q12778 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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FOXO1Q12778 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXO1Q12778 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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